2．5．3核酸疫苗
核酸疫苗包括DNA疫苗和RNA疫苗。目前，研究较多的是DNA疫苗，它由编码能引起保护性免疫反应的病原体抗原基因片段和载体构建而成。核酸疫苗克服了减毒活疫苗的可能返祖并导致人类和动物疾病，以及病毒发生变异而对新型的变异株不起作用的缺点，因此被视为疫苗业的一场革命，开辟了疫苗研究的新时代。
KristopHer等用绿色荧光蛋白替换TGEV基因组ORF3a，构建成TGEV-GFP重组体转染BHK细胞后，能够分离到有效表达绿色荧光蛋白的TGEV—GFP重组体。任晓峰等应用pCl新型真核融合表达载体分别表达TGEV TH298株的全长S基因和主要抗原位点(A、C、D)片段，构建了含有TGEV全长S基因及其主要抗原位点区的核酸疫苗，将重组核酸疫苗免疫小鼠后发现后者的免疫效果优于前者。
2．5．4转基因植物疫苗
转基因植物疫苗是把植物基因工程技术与机体免疫机理相结合，生产出能使机体获得特异抗病能力的疫苗。动物试验已证实，转基因植物表达的抗原蛋白经纯化后仍保留了免疫学活性，注射入动物体内能产生特异性抗体；用转基因植物组织饲喂动物，转基因植物表达的抗原递呈到动物的肠道相关淋巴组织，被其表面特异受体特别是M细胞所识别，产生黏膜和体液免疫应答。
GOinez将TGEV的S基因克隆到花椰菜花叶病毒(CaMV35S)启动子下游，转染到植物种子中，植株生长的大多数叶子可用特异性单克隆抗体检NNs基因表达的多肽，从而成功地构建了TGEV转基因植物疫苗。用这种植物饲喂猪，产生了中和抗体和免疫保护作用。随后Gomez等(2000)用转基因马铃薯表达了包含S糖蛋白氨基端区域的主要抗原位点。将表达抗原位点区的马铃薯块茎提取物腹膜内免疫小鼠，接种的小鼠产生了对TGEV特异的血清IgG。而且用马铃薯块茎直接饲喂小鼠时，小鼠产生了对糖蛋白特异的血清抗体。目前还有一个研究方向，就是将克隆并修饰的致病大肠杆菌热敏肠毒素B亚单位LT—B基因和HTGEV的S基因分别导入土豆基因组，利用LT—B的黏膜免疫剂作用和载体效应克服单独表达S基因可能具有的免疫耐受性，选取表达水平较高的阳性转基因土豆克隆繁殖后喂猪，使动物建立免疫。
总之，猪传染性胃肠炎病毒s基因分子生物学研究的进一步发展和应用，不仅促进了其结构蛋白、核酸结构、基因表达方式等方面研究的深入，也促进了基于s基因进行转基因研制新型基因工程疫苗的发展。目前的研究结果表明，S基因的合理剪切对于抗原活性没有太大的影响，并且可操作性更强，更有利于和某些信号肽基因拼接重组，从而使S蛋白能Ⅲ页利到达靶部位或使外源基因在某些组织得到高效表达。因此对于保留抗原位点的S基因采用怎样的包埋手段或与怎样基因重组是进行转基因研究的一个重要发展方向。尽管s基因在各种载体中得到了有效表达，但还是没有高效的基因工程疫苗投入到生产当中，基因工程疫苗的研发仍是TGEV研究的重点。
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