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每日一问:为什么不采用全部分型数据而是选择其中部分位点数据?

作者:猪易公开课来源:猪易公开课时间:2023-05-23 09:10点击:

每日一问:为什么不采用全部分型数据而是选择其中部分位点数据?

湖南农业大学动物科技学院副院长何俊博士:主要有两个方面原因,第一,因为不同公司可能会使用不同类型或品牌的SNP基因芯片来进行分析。这些芯片的位点是不完全一样的。第二,通过我们团队前期的预实验发现,在分析过程中,如前面提到的线性回归方法,随着SNP密度的增加,它的准确性会提高。但是实际上,SNP密度的提高并不是无限制的提高,就可以越来越准确的。因为随着SNP密度增加的时候,从数据上面来讲,它的共线性就会一定程度的存在,会在数据分析上带来一些噪音,反倒带来分析的偏差。所以需要一个数据筛选过程,把产生噪音的信息去掉,因而就只需要用部分的数据。


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