疫苗的接种方法皮下注射。皮下注射是目前使用最多的一种方法，大多数疫苗都是经这一途径免疫。皮下注射是将疫苗注入皮下组织后，经毛细血管吸收进入血流，通过血液循环到达淋巴组织，从而产生免疫反应。注射部位多在耳根皮下，皮下组织吸收比较缓慢而均匀，油类疫苗不宜皮下注射。
肌肉注射。肌肉注射是将疫苗注射于肌肉内，注射时注意针头要足够长，以保证疫苗确实注入肌肉里。
超前免疫。是指在仔猪未吃初乳时注射疫苗，注苗后1-2小时才给吃初乳，目的是避开母源抗体的干扰和使疫苗毒尽早占领病毒复制的靶位，尽可能早地刺激产生基础免疫，这种方法常用在猪瘟的免疫上。
滴鼻接种。滴鼻接种是属于粘膜免疫的一种，粘膜是病原体侵入的最大门户，有95%的感染发生在粘膜或由粘膜侵入机体，粘膜免疫接种既可刺激产生局部免疫，又可建立针对相应抗原的共同粘膜免疫系统工程；粘膜免疫系统能对粘膜表面不时吸入或食入的大量种类繁杂的抗原进行准确的识别并作出反应，对有害抗原或病原体产生高效体液免疫反应和细胞免疫反应。目前使用比较广泛的是猪伪狂犬病基因缺失疫苗的滴鼻接种。
口服接种。由于消化道温度和酸碱度都对疫苗的效果有很大的影响，因此这种方法目前很少使用。
气管内注射和肺内注射。这两种方法多用在猪喘气病的预防接种。
穴位注射。在注射有关预防腹泻的疫苗时多采用后海穴注射，能诱导较好免疫反应。
各类疫苗特点冷冻真空干燥疫苗。大多数的活疫苗都采用冷冻真空干燥的方式冻干保存，可延长疫苗的保存时间，保持疫苗的效价。病毒性冻干疫苗常在-15℃以下保存，一般保存期2年。细菌性冻干疫苗在-15℃保存时，一般保存期2年；2℃-8℃保存时，保存期9个月。
油佐剂灭活疫苗。这类疫苗为灭活疫苗，以白油为佐剂乳化而成，大多数病毒性灭活疫苗采用这种方式。油佐剂疫苗注入肌肉后，疫苗中的抗原物质缓慢释放，从而延长疫苗的作用时间。这类疫苗2℃-8℃保存，禁止冻结。
铝胶佐剂疫苗。以铝胶按一定比例混合而成，大多数细菌性灭活疫苗采用这种方式，疫苗作用时间比油佐剂疫苗快。2℃-8℃保存，不宜冻结。
蜂胶佐剂灭活疫苗。以提纯的蜂胶为佐剂制成的灭活疫苗，蜂胶具有增强免疫的作用，可增加免疫的效果，减轻注苗反应。这类灭活疫苗作用时间比较快，但制苗工艺要求高，需高浓缩抗原配苗。2℃-8℃保存，不宜冻结，用前充分摇匀。
使用疫苗的注意事项根据实际情况，选择可靠和适合自己猪场的疫苗及相应的血清型，基本原则是选用好疫苗，用好疫苗。免疫程序必须根据实际防疫效果适当修正。
注意疫苗质量问题，超温保存失效疫苗和过期疫苗、失真空疫苗不能使用，疫苗自稀释后15℃以下4小时、15℃-25℃2小时、25℃以上1小时内用完。
注射时注意用具的消毒，防止交叉感染，从现在情况看，像猪蓝耳病、伪狂犬病等阳性率比较高或猪瘟隐性带毒猪存在，每头猪一个针头虽然麻烦，但非常有必要。
注射要准确，不能少注漏注。滴鼻接种时操作一定要细心，疫苗稀释时准确掌握稀释液用量，增加滴鼻后疫苗停留时间。
防止药物对疫苗接种的干扰和疫苗相互之间的干扰，在注射病毒性疫苗的前后3天严禁使用抗病毒药物，两种病毒性活疫苗的使用要间隔7-10天，减少相互干扰。病毒性活疫苗和灭活疫苗可同时分开使用。注射活菌疫苗前后5天严禁使用抗菌素，两种细菌性活疫苗可同时使用。抗菌素对细菌性灭活疫苗没有影响。
稀释疫苗时一定要按照疫苗使用说明的要求选用稀释液。
不能随便加大疫苗的用量，确需加大量时要在当地兽医指导下使用。细菌性活疫苗，如猪肺疫活疫苗、链球菌活疫苗、猪丹毒活疫苗等虽然是弱毒疫苗，按规定剂量使用是安全的，但毕竟还是有部分毒力，在使用时应严格按说明书剂量使用。
个别猪只因个体差异，在注射油佐剂疫苗、需要牛血清培养
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