但是，妊娠母猪全程采用限位栏饲养工艺会使母猪的淘汰率增高、利用年限降低。因限位栏饲养导致母猪无法自由活动、运动不足，犬坐增加，阴道炎发病率增加，影响母猪的繁殖率；限位环境单调，缺乏有效的环境刺激，母猪咬栏和空嚼等异常行为增多；限位栏饲养，由于母猪缺乏运动，肠肌无力，肠蠕动缓慢，导致便秘，难产率增高，体况下降，免疫力下降，难以承受各种病原的侵袭；限位栏饲养使母猪肢蹄病增多。有专家研究表现，种母猪长期限位饲养直接影响心肺功能（剖检可见全心扩张，尤其右心室与右心房，心机松软）。
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