蓝耳病病毒在中国商品化育肥猪场的流行和遗传演化

该研究为了调查猪繁殖与呼吸综合征病毒（porcine reproductive and respiratory syndrome virus, PRRSV）在商品化育肥猪场的流行和遗传演化，2020-2021年期间在黑龙江、河南、新疆、河北、湖北的7个养猪场的育肥猪群中共采集1397份临床样本。对所有的临床样本进行PRRSV RT-PCR检测，并对阳性样本测序后进行遗传进化树分析和氨基酸比对。

RT-PCR检测结果显示，7个农场均检测到了PRRSV，其中所有农场均检测到了PRRSV美洲株，而仅有河南场检测到了PRRSV欧洲株。从检测到的阳性样本中获得了344个NSP2部分基因序列和334个ORF5完整基因序列，进行测序分析后，结果显示，检测到的PRRSV美洲株包括了6种毒株，且7个农场中有5个存在两种或以上PRRSV美洲株毒株（表1）；而PRRSV欧洲株仅存在于一个商业育肥场中。7个猪场中有5个主要流行毒株是L1.8（L1C），但不同商业育肥猪场的 L1.8（L1C）PRRSV同源性差异很大。氨基酸比对结果表明，不同 L1.8（L1C）毒株的NSP2均存在131个氨基酸不连续缺失，GP5突变主要集中在信号肽区域和T细胞表位。GP5的选择压力分析显示，使用PRRSV MLV疫苗没有显著影响 L1.8（L1C）PRRSV的多样化效应。

结果表明我国商业育肥猪场PRRSV感染较为常见，个体阳性率水平很高。中国商业育肥猪场存在多种PRRSV毒株感染。L1.8（L1C）是商业育肥猪场主要循环感染的PRRSV毒株。在不同商业育肥猪场检测到的L1.8（L1C）PRRSV在同源性上表现出显著差异，但分子特征相似。对 L1.8（L1C）PRRSV GP5的压力可能与疫苗的使用没有直接关系。

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